Мисс Скалли украшает квартиру дочери, готовясь к празднику в честь скорого появления малыша на свет. Она донимает дочь расспросами, надеясь узнать, мальчика или девочку ожидает Скалли. Но у мисс Скалли есть и свой сюрприз - она наняла няню, Лиззи Гилл, чтобы та помогала упорно отказывающейся от материнской поддержки Скалли. Во время вечеринки Лиззи незаметно уходит в ванную комнату. Там она вынимает из шкафчика с лекарствами пузырек с прописанными Скалли таблетками и выбрасывает их в туалет. Вынув из кармана пакетик других таблеток, она пересыпает их в пузырек. Доктор Лев (в последний раз появлявшийся в 8X08) допоздна задерживается в лаборатории Зевс Генетикс. Он держит в руках уродливого младенца, когда в лабораторию заходит Билли Майлс (в последний раз появлявшийся в 8X15). "Твоя работа окончена", - говорит Билли. Он обезглавливает доктора одним движением руки и поджигает тело. Утром следующего дня на пороге квартиры Доггетта неожиданно появляется Малдер. Он заставляет Доггетта посмотреть телерепортаж о пожаре в Зевс Генетикс. Малдер уверен, что пожар начался не случайно, и Доггетт отправляет агента Крейна проверить то, что осталось от лаборатории. Единственным человеком, не найденным после пожара, оказывается доктор Лев, партнер в Зевсе доктора Паренти, врача, который вел начало беременности Скалли. Малдер и Доггетт приезжают в офис Паренти и сталкиваются там с самим доктором. Когда Доггетт обнаруживает в одной из комнат полки, заставленные банками с образцами уродливых зародышей, Малдер обвиняет доктора в проведении экспериментов с инопланетными эмбрионами. Лиззи Гилл покидает квартиру Скалли и садится в машину Даффи Хаскелла, в последний раз появлявшегося в эпизоде 8X08 как один из организаторов экспериментов по имплантации эмбрионов пришельцев в похищенных женщин. "Я думаю, она мне доверяет", - говорит Лиззи Даффи. Доктор Паренти спешно упаковывает банки с образцами зародышей в своем офисе, когда слышит за спиной шаги. В комнату входит Билли Майлс. Паренти объявляет, что его офис закрыт. "Да, закрыт", - спокойно соглашается Билли. Поздно вечером Малдер и Доггетт, которых насторожили тщетные попытки дозвониться до Паренти, проникают в офис доктора. Среди банок с образцами зародышей Доггетт находит банку с головой Паренти. Внезапно появившийся Билли Майлз застает Малдера врасплох и наносит ему удар, от которого Малдер пролетает сквозь стеклянное окно. Доггетт, увидев уплотнение, отличающее пришельцев, на шее Билли, стреляет в Майлса, но тот исчезает. У себя в квартире Скалли зашивает рану Малдера. Малдер развивает теорию о том, что Билли превратился в пришельца, но сам Малдер не прошел процесс преобразования до конца благодаря вмешательству Скалли в больнице. Доггетт отмечает, что Билли отличается от других пришельцев красной кровью - Доггетт видел ее, когда стрелял в Билли. Малдер приходит к выводу, что агенты столкнулись с гибридом человека и пришельца, и опасается за безопасность ребенка Скалли. Лиззи, подслушав разговор, звонит Даффи. Даффи не успевает ответить, поскольку оказывается лицом к лицу с Билли Майлсом. Пришелец срезает голову Даффи одним ударом руки. Тело Даффи найдено в нелегальной медицинской лаборатории, используемой для экспериментов по клонированию. Там же Скиннер находит записи о протекании беременности Скалли, которые вели доктор Лев и доктор Паренти. Скиннер отводит Малдера в сторону и спрашивает, знает ли бывший агент историю появления ребенка. Малдеру, к удивлению Скиннера, нечего ответить. Малдер звонит Скалли и говорит, что ему необходимо немедленно увидеть ее, чтобы задать несколько вопросов о ее беременности. Услышав странный шум, Скалли заглядывает в ванную комнату в видит как Лиззи подменяет лекарство. "Кто ты?", - требует ответа Скалли. После полного осмотра врач Скалли объявляет, что ребенок в безопасности. Таблетки, которые Скалли пила вместо назначенных, оказываются безвредными витаминными добавками. Доггетт допрашивает Лиззи, и та рассказывает, что работала в составе команды, занимающейся клонированием человека. Ученые научились вводить яйцеклетку пришельца в организм земной женщины. Малдер приходит в ярость. "Что вы сделали со Скалли?", - кричит он. Лиззи заявляет, что в ребенке Скалли нет ничего необычного. Он самый настоящий человек, и Лиззи пыталась защитить малыша. Агент Крейн сообщает Доггетту, что позвонивший Билли Майлс пообещал сдаться властям. Команда быстрого реагирования врывается в офис доктора Паренти, но не находит там Билли. Чувствуя опасность, Малдер приказывает Скалли собирать вещи, чтобы покинуть квартиру. Доггетт сообщает Малдеру, что офис доктора пуст. В это время в квартире Скалли выключается свет. Билли появляется в коридоре секундами разминувшись с Малдером и Скалли, которые по лестнице выбираются из дома. Однако машина Малдера оказывается зажата другими припаркованными машинами, и Билли приближается к оказавшимся в ловушке агентам. Когда он выходит на дорогу, его сбивает внезапно появившаяся машина. Потрясенные Малдер и Скалли слышат предложение водителя - Крайчека - пересесть к нему. Билли Майлс поднимается с дороги и смотрит вслед удаляющимся огням. В здании ФБР Крайчек рассказывает собравшимся агентам, что пришельцы боятся ребенка Скалли, потому что тот сильнее их. Доггетт не доверяет Крайчеку и вызывает агента Монику Рейес, которая прилетела в Вашингтон, готовая помочь. Скиннер и Малдер ведут Скалли к лифту, но когда они спускаются в гараж, Доггетт звонит Малдеру, чтобы предупредить, что в гараже появился Билли Майлс. Агенты возвращаются в лифт, Билли бросается за ними по ступенькам. Крайчек прячет Скалли, а Скиннер и Малдер, уводя за собой Билли, продолжают подниматься в лифте на последний этаж. Доггетт сажает Скалли в машину к Рейес. На крыше Билли уже собирается нанести удар Скиннеру, когда подобравшийся сзади Малдер сбрасывает его с крыши. Билли падает на грузовик, собирающий мусор, и попадает в работающий пресс. Скалли и Рейес пытаются выехать из гаража, но их останавливает агент Крейн. Он смотрит, как пресс грузовика сжимает Билли, а затем машет женщинам рукой, предлагая вывести машину из гаража. Никто из агентов не замечает уплотнение на шее Крейна. ПРОДОЛЖЕНИЕ СЛЕДУЕТ.